Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms