Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNC1Q01954 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms