Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAP1Q01518 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms