Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLTCQ00610 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms