Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX1P83916 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX1P83916 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms