Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms