Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms