Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms