Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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