Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF10P55107 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF10P55107 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF10P55107 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF10P55107 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF10P55107 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms