Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HADHBP55084 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHBP55084 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms