Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms