Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HK3P52790 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HK3P52790 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms