Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNPDA1P46926 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms