Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNA4P43681 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNA4P43681 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms