Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms