Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM5CP41229 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms