Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms