Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDI1P31150 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDI1P31150 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDI1P31150 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDI1P31150 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GDI1P31150 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDI1P31150 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDI1P31150 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDI1P31150 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDI1P31150 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDI1P31150 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDI1P31150 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDI1P31150 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDI1P31150 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDI1P31150 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDI1P31150 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDI1P31150 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDI1P31150 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms