Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TSPOP30536 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TSPOP30536 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TSPOP30536 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TSPOP30536 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TSPOP30536 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TSPOP30536 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TSPOP30536 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TSPOP30536 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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