Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NFKBIAP25963 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms