Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms