Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MMP11P24347 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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