Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRCP23327 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRCP23327 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HRCP23327 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
HRCP23327 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HRCP23327 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms