Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms