Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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