Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRAFP15056 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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