Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms