Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms