Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PGA3P0DJD8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms