Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DQB1P01920 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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