Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX6O95503 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX6O95503 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX6O95503 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBX6O95503 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX6O95503 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms