Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG7O95352 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATG7O95352 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG7O95352 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG7O95352 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG7O95352 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG7O95352 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATG7O95352 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms