Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms