Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51BO15315 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms