Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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