Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms