Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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