Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms