Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP29Q9HBJ7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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