Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms