Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXP3Q9BZS1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FOXP3Q9BZS1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXP3Q9BZS1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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