Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CNTNAP3Q9BZ76 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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CNTNAP3Q9BZ76 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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