Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PACSIN1Q9BY11 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms