Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFHD1Q9BUP0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms