Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms