Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERPUD2Q9BSE4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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