Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SAMD8Q96LT4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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