Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM47Q96LD4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms