Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX13Q92968 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX13Q92968 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms